2005年4月12日，獨(dú)聯(lián)體執(zhí)行委員會與上合組織秘書處在北京簽署諒解備忘錄，獨(dú)聯(lián)體成為第一個與上合組織以簽署具有法律效力的文件來確立合作關(guān)系的國際組織。4月21日，上合組織秘書處與東盟秘書處簽署了諒解備忘錄。7月5日，上合組織給予巴基斯坦、伊朗、印度觀察員國地位。11月4日，上合組織與阿富汗簽署關(guān)于建立聯(lián)絡(luò)小組的議定書。
2006年5月22日，上合組織論壇在莫斯科成立。6月15日，六國元首簽署了《上海合作組織五周年宣言》等重要文件，為上合組織的下一步發(fā)展確定了方向和任務(wù)。
2007年8月16日，六國元首在吉首都比什凱克簽署了《上海合作組織成員國長期睦鄰友好合作條約》，把成員國人民“世代友好、永保和平”的思想以法律形式確定下來。
2008年8月28日，元首理事會第八次會議在塔吉克斯坦首都杜尚別舉行。六國元首就上海合作組織發(fā)展和合作重點(diǎn)方向、相互關(guān)系準(zhǔn)則、對外交往基本立場等達(dá)成新的重要共識。會議通過了《上海合作組織成員國元首杜尚別宣言》 《上海合作組織對話伙伴條例》等重要文件。